近親交配を行った場合、どの猫種でも内臓奇形が起こる可能性があります。
ただスコティッシュフォールドの場合、どんなに血統を離しても、異種交配(ハイブリッド)しないかぎり広い意味でのラインブリードになります。
従って他の猫種に比べて内臓奇形を伴う可能性は高く、だからこそ、耳折れ同士の交配は絶対に避ける必要があります。
スコティッシュフォールドにとって立ち耳(Straight)やアメリカンショートヘア(ASH)、ブリティッシュショートヘア(BSH)の存在はとても重要なのです。
また異種交配に使うアメリカンショートヘア、ブリティッシュショートヘアの血統内容も検討する必要があります。